Амерички центри за контролу и превенцију болести, ЦДЦ, покренули су конзорцијум за покретање националне мреже лабораторија за секвенцирање које ће убрзати објављивање података о секвенци САРС-ЦоВ-2 у јавно власништво. Брзо објављивање отворених података о секвенци вируса корона помоћи ће у томе ЦОВИД-19 одговор јавног здравља, покретати иновације и открића и унапредити разумевање ове и будућих пандемија.
ovo Секвенцирање САРС-ЦоВ-2 за одговор на ванредне ситуације јавног здравља, епидемиологију и надзор (СФЕРЕС) конзорцијум, који ће у великој мери проширити употребу секвенцирање целог генома (ВГС) вируса ЦОВИД-19. СПХЕРЕ ће обезбедити доследне податке о секвенцама у реалном времену тимовима јавног здравља који истражују случајеве и групе ЦОВИД-19 широм земље.
Овај нови конзорцијум ће им помоћи да боље разумеју како се вирус шири, како на националном нивоу, тако иу њиховим локалним заједницама. Бољи подаци ће заузврат помоћи службеницима јавног здравља да прекину ланце преноса, спрече нове случајеве болести и заштите и спасу животе.
„САД су светски лидер у напредном брзом секвенцирању генома. Овај координисани напор у нашим јавним, приватним, клиничким и академским лабораторијама јавног здравља играће виталну улогу у разумевању преноса, еволуције и лечења САРС-ЦоВ-2. Уверен сам да наши најбољи, највештији умови раде заједно како би нам помогли да спасемо животе данас и сутра“, рекао је директор ЦДЦ Роберт Редфилд, др.
Праћење вируса ЦОВИД-19 како се развија
Подаци геномске секвенце могу дати увид без преседана у биологију САРС-ЦоВ-2, вируса који изазива ЦОВИД-19, и помоћи у дефинисању променљивог пејзажа пандемије. Секвенционисањем вируса широм Сједињених Држава, ЦДЦ и други органи за јавно здравство могу да прате важне промене у вирусу и користе ове информације да усмеравају праћење контаката, напоре за ублажавање последица јавног здравља и стратегије контроле инфекције.
Конзорцијум СПХЕРЕС представља амбициозан напор да координира секвенцирање генома САРС-ЦоВ-2 на националном нивоу, организујући десетине мањих, појединачних напора у јединствену, дистрибуирану мрежу лабораторија, институција и корпорација. Конзорцијум комбинује стручност, технологију и ресурсе 40 државних и локалних одељења за јавно здравље, неколико великих клиничких лабораторија и преко двадесетак сарадничких институција широм савезне владе, академске заједнице и приватног сектора.
СПХЕРС ће успоставити најбоље праксе и стандарде за консензус података, убрзати отворену дељење података и успоставити скуп ресурса и стручности како би помогао да се најсавременија технологија унесе у национални одговор на ЦОВИД-19.
СФЕРЕС подаци отворени, дељени
Чланови конзорцијума деле посвећеност брзој отвореној подели секвенци. Они планирају да доставе све корисне податке о секвенци у јавна спремишта у Националном центру за биотехнолошке информације Националне медицинске библиотеке (НЛМ/НЦБИ), Глобалној иницијативи за дељење података о птичијој инфлуенци (ГИСАИД) и другим јавним репозиторијумима секвенци. Ово ће помоћи да се осигура да подаци о вирусној секвенци широм Сједињених Држава буду брзо доступни за доношење одлука у јавном здравству и слободно доступни истраживачима свуда.
Чланови конзорцијума укључују:
Савезне агенције и лабораторије
Центри за контролу и превенцију болести, Канцеларија за напредне молекуларне детекције
Аргон Национална лабораторија
Агенција за одбрану здравља, Глобал Инфецтиоус Болест Надзор
За храну и лекове
Лавренце Беркелеи Натионал Лаборатори
Национална лабораторија Лос Аламос
Национални институт за алергију и инфективне болести, Канцеларија за геномику и напредну технологију
Национални институт за стандарде и технологију
Национални центар за биотехнолошке информације Националне медицинске библиотеке
Волтер Реед Арми Институте оф Ресеарцх
Државне/локалне лабораторије јавног здравља
Аризона
Калифорнија
Делавер
Дистрикт Колумбија
Флорида
Хаваји
Мејн
Мериленд
Масачусетс
Мичиген
Минесота
Северна Каролина
Северна Дакота
Невада
Нови Мексико
ЦА
Јута
Вирџинија
Вашингтон
Висконсин
Вајоминг
Академске институције
Баилор Университи
Универзитет Корнел
Фред Хутцхинсон Центар за истраживање рака
Медицински факултет Моунт Синаи
Нев Иорк Университи
Универзитет Северне Аризоне
Универзитет у Буфалу
Универзитет Калифорније
Университи оф Цалифорниа, Давис
Университи оф Цалифорниа, Ирвине
Калифорнијски универзитет, Лос Ангелес
Университи оф Цалифорниа, Сан Францисцо
Калифорнијски универзитет, Санта Цруз
Университи оф Цхицаго
Университи оф Мариланд
Универзитет у Минесоти
Университи оф Небраска
Универзитет у Новом Мексику
Универзитет у Вашингтону
Универзитет Јејл
Корпорације
Абботт Диагностицс
биоМериеук
Геномика боја
Гингко Биоворкс
ИДбиДНА
Ин-К-Тел
ЛабЦорп
Један кодекс
Окфорд Нанопоре Тецхнологиес
Пацифиц Биосциенцес
Киаген
Куест Диагностицс
Верили Лифе Сциенцес
Називи корпорација су дати само у информативне сврхе и њихово укључивање овде не представља подршку корпорација или било ког њиховог комерцијалног производа или услуге од стране америчких центара за контролу и превенцију болести.
Непрофитни институти за јавно здравље или истраживачки институти
Удружење лабораторија за јавно здравље
Бил и Мелинда Гејтс
Широки институт
Цхан Зуцкерберг БиоХуб
Институт Цраиг Вентер
Јавноздравствени савез за геномску епидемиологију
Сцриппс Ресеарцх
Јацксон Лаборатори
Институт за истраживање транслационе геномике – север
Валдер фондација
У протеклих шест година, ЦДЦ-ов Уред за напредну молекуларну детекцију улагао је у савезне и државне лабораторије јавног здравља како би проширио употребу геномике патогена и других напредних лабораторијских технологија за надзор заразних болести и одговор на епидемију. Тренутна инвестиција конзорцијума има за циљ да спасе животе у пандемији САРС-ЦоВ-2 и припреми Сједињене Државе и свет за будући одговор на пандемију.
Да бисте сазнали више о геномском секвенцирању или раду ЦДЦ-а у напредној молекуларној детекцији, посетите https://www.cdc.gov/amd/
